Originariamente, monasterio dedicado a San Juan Bautista, aunque se supone que anteriormente se asentaba en sus cimientos un templo romano. Con la muerte de San Isidoro, obispo de Sevilla, Doctor de las Españas, y con el traslado de sus restos a León, se cambia la titularidad del edificio.El conjunto isidoriano, en su expresión del mundo románico, se lo considera el más completo de España, y algunos creen que es el más completo de occidente.
De estilo románico en su mayor parte. Con algunos añadidos góticos y renacentistas.
En el Panteón de los Reyes están enterrados casi todos los reyes del Reino de León. En sus bóvedas están los más importantes frescos románicos de Europa.